public class ArchiveUtils
extends java.lang.Object
Constructor and Description |
---|
ArchiveUtils() |
Modifier and Type | Method and Description |
---|---|
static void |
calculateDrift(MoleculeArchive<Molecule,MarsMetadata,MoleculeArchiveProperties<Molecule,MarsMetadata>,MoleculeArchiveIndex<Molecule,MarsMetadata>> archive,
java.lang.String backgroundTag,
java.lang.String input_x,
java.lang.String input_y,
boolean use_incomplete_traces,
java.lang.String mode,
java.lang.String zeroPoint) |
static void |
calculateDrift(MoleculeArchive<Molecule,MarsMetadata,MoleculeArchiveProperties<Molecule,MarsMetadata>,MoleculeArchiveIndex<Molecule,MarsMetadata>> archive,
java.lang.String backgroundTag,
java.lang.String input_x,
java.lang.String input_y,
boolean use_incomplete_traces,
java.lang.String mode,
java.lang.String zeroPoint,
boolean singleChannel,
int theC,
org.scijava.log.LogService logService) |
static void |
calculateDrift(MoleculeArchive<Molecule,MarsMetadata,MoleculeArchiveProperties<Molecule,MarsMetadata>,MoleculeArchiveIndex<Molecule,MarsMetadata>> archive,
java.lang.String backgroundTag,
java.lang.String input_x,
java.lang.String input_y,
boolean use_incomplete_traces,
java.lang.String mode,
java.lang.String zeroPoint,
org.scijava.log.LogService logService) |
static void |
correctDrift(MoleculeArchive<Molecule,MarsMetadata,MoleculeArchiveProperties<Molecule,MarsMetadata>,MoleculeArchiveIndex<Molecule,MarsMetadata>> archive,
java.lang.String input_x,
java.lang.String input_y,
java.lang.String output_x,
java.lang.String output_y) |
static void |
correctDrift(MoleculeArchive<Molecule,MarsMetadata,MoleculeArchiveProperties<Molecule,MarsMetadata>,MoleculeArchiveIndex<Molecule,MarsMetadata>> archive,
java.lang.String input_x,
java.lang.String input_y,
java.lang.String output_x,
java.lang.String output_y,
boolean singleChannel,
int theC,
org.scijava.log.LogService logService) |
static void |
correctDrift(MoleculeArchive<Molecule,MarsMetadata,MoleculeArchiveProperties<Molecule,MarsMetadata>,MoleculeArchiveIndex<Molecule,MarsMetadata>> archive,
java.lang.String input_x,
java.lang.String input_y,
java.lang.String output_x,
java.lang.String output_y,
org.scijava.log.LogService logService) |
static boolean |
isVirtualArchive(java.io.File file) |
static boolean |
isVirtualArchive(java.lang.String url) |
static boolean |
isVirtualArchive(java.net.URI uri) |
static java.io.File |
jsonFileExtensionFixer(java.io.File file) |
static java.lang.String |
jsonFileExtensionFixer(java.lang.String url) |
static java.io.File |
storeFileExtensionFixer(java.io.File file) |
static java.lang.String |
storeFileExtensionFixer(java.lang.String url) |
static void |
updateTableHeaders(MoleculeArchive<Molecule,MarsMetadata,?,?> archive) |
static java.io.File |
yamaFileExtensionFixer(java.io.File file) |
static java.lang.String |
yamaFileExtensionFixer(java.lang.String url) |
public static boolean isVirtualArchive(java.io.File file)
public static boolean isVirtualArchive(java.net.URI uri)
public static boolean isVirtualArchive(java.lang.String url)
public static java.io.File yamaFileExtensionFixer(java.io.File file)
public static java.lang.String yamaFileExtensionFixer(java.lang.String url)
public static java.io.File jsonFileExtensionFixer(java.io.File file)
public static java.lang.String jsonFileExtensionFixer(java.lang.String url)
public static java.io.File storeFileExtensionFixer(java.io.File file)
public static java.lang.String storeFileExtensionFixer(java.lang.String url)
public static void calculateDrift(MoleculeArchive<Molecule,MarsMetadata,MoleculeArchiveProperties<Molecule,MarsMetadata>,MoleculeArchiveIndex<Molecule,MarsMetadata>> archive, java.lang.String backgroundTag, java.lang.String input_x, java.lang.String input_y, boolean use_incomplete_traces, java.lang.String mode, java.lang.String zeroPoint)
public static void calculateDrift(MoleculeArchive<Molecule,MarsMetadata,MoleculeArchiveProperties<Molecule,MarsMetadata>,MoleculeArchiveIndex<Molecule,MarsMetadata>> archive, java.lang.String backgroundTag, java.lang.String input_x, java.lang.String input_y, boolean use_incomplete_traces, java.lang.String mode, java.lang.String zeroPoint, org.scijava.log.LogService logService)
public static void calculateDrift(MoleculeArchive<Molecule,MarsMetadata,MoleculeArchiveProperties<Molecule,MarsMetadata>,MoleculeArchiveIndex<Molecule,MarsMetadata>> archive, java.lang.String backgroundTag, java.lang.String input_x, java.lang.String input_y, boolean use_incomplete_traces, java.lang.String mode, java.lang.String zeroPoint, boolean singleChannel, int theC, org.scijava.log.LogService logService)
public static void correctDrift(MoleculeArchive<Molecule,MarsMetadata,MoleculeArchiveProperties<Molecule,MarsMetadata>,MoleculeArchiveIndex<Molecule,MarsMetadata>> archive, java.lang.String input_x, java.lang.String input_y, java.lang.String output_x, java.lang.String output_y)
public static void correctDrift(MoleculeArchive<Molecule,MarsMetadata,MoleculeArchiveProperties<Molecule,MarsMetadata>,MoleculeArchiveIndex<Molecule,MarsMetadata>> archive, java.lang.String input_x, java.lang.String input_y, java.lang.String output_x, java.lang.String output_y, org.scijava.log.LogService logService)
public static void updateTableHeaders(MoleculeArchive<Molecule,MarsMetadata,?,?> archive)
public static void correctDrift(MoleculeArchive<Molecule,MarsMetadata,MoleculeArchiveProperties<Molecule,MarsMetadata>,MoleculeArchiveIndex<Molecule,MarsMetadata>> archive, java.lang.String input_x, java.lang.String input_y, java.lang.String output_x, java.lang.String output_y, boolean singleChannel, int theC, org.scijava.log.LogService logService)